Está regido por una Fundación sin ánimo de lucro con entidad jurídica propia, , haciendo todo lo posible para agilizar los procedimientos administrativos y eliminar obstáculos burocráticos, tanto como sea posible.
La utilización de las instalaciones del Centro está abierta a toda la comunidad científica internacional. Cualquier grupo de científicos puede proponer la organización de una reunión de carácter internacional centrada en una temática concreta. Una vez aprobada la propuesta, los organizadores dispondrán de los servicios de secretaría, de gestor de sistemas informáticos, de creación y mantenimiento de web, de registro de solicitudes y de reservas de hotel.
El Centro de Ciencias de Benasque Pedro Pascual compite de forma amistosa con otros centros de reuniones reconocidos como los de Aspen, Les Houches o Dresden, por nombrar algunos ejemplos.